Candidatus

A prokariótanevezéktanban a Candidatus (röviden Ca., a „római hivatal jelöltje” jelentésű latin szóból) a jól leírt, de még nem tenyésztett prokariótataxonok megnevezésére használt szó.[1] A modern szekvenálási módszerek, például a 16S-rRNS-szekvenálás vagy a metagenomika az elemzett élőlényekről több információt nyújtanak, és lehetővé teszik egyes fajok azonosítását és leírását. Azonban a legtöbb faj nem tenyészthető, így in vitro tanulmányban nem jellemezhető. Ezek újabb felfedezése a Candidatustörzs-radiációhoz vezetett, mely a bakteriális diverzitás új ismereteivel bővítette az életfát.
Nevezéktan
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]Történet
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]Az eredeti Nemzetközi Prokarióta-nevezéktani Kódex (ICNP) és korai változatai nem vették figyelembe a még tenyészthetetlen prokarióták azonosítását. Ezért a Candidatust a NEmzetközi Prokarióta-rendszertani Tanács (ICSP, korábban Nemzetközi Rendszertani Bakteriológiai Társaság, ICSB) 1994-es konferenciáján javasolták a kódexmódosítás indítványozásához.[2] A szekvenálási technológiák fejlődése révén növekvő Candidatus-taxon-szám révén az ICSP a Nemzetközi Prokarióta-nevezéktani Kódexbe 1996-ban hozzáadott egy függeléket a Candidatus-taxonokról[3] (a legújabb kiadásban 11. függelék).[4] Azonban a Candidatus-taxonok nevezéktanát a kódex továbbra se tartalmazza, ezért viták és tervezetek jelentek meg a kódex megváltoztatására a Candidatus-taxonok elsődlegességének biztosításához.[5][6]
Példa
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]A Desulforudis audaxviator baktérium teljes tudományos neve Candidatus Desulforudis audaxviator. A baktériumot egy dél-afrikai aranybányában fedezték fel, 2,8 km mélyen, 60 °C-os hőmérsékleten, anaerob, radioaktív környezetben él, laboratóriumi szaporítása nem megoldott.
Jegyzetek
[szerkesztés | forrásszöveg szerkesztése]- ↑ Stackebrandt, E. (2002. május 1.). "Report of the ad hoc committee for the re-evaluation of the species definition in bacteriology". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (3): 1043–1047. doi:10.1099/ijs.0.02360-0. PMID 12054223.[halott link]
- ↑ Murray, R. G. E.; Schleifer, K. H. (1994. január 1.). "Taxonomic Notes: A Proposal for Recording the Properties of Putative Taxa of Procaryotes". International Journal of Systematic Bacteriology (angol nyelven). 44 (1): 174–176. doi:10.1099/00207713-44-1-174. ISSN 0020-7713. PMID 8123559.
- ↑ Tindall, Brian J.; Kämpfer, Peter; Euzéby, Jean P.; Oren, Aharon (2006. november 1.). "Valid publication of names of prokaryotes according to the rules of nomenclature: past history and current practice". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (angol nyelven). 56 (11): 2715–2720. doi:10.1099/ijs.0.64780-0. ISSN 1466-5026. PMID 17082418.
- ↑ "International Code of Nomenclature of Prokaryotes: Prokaryotic Code (2008 Revision)". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (angol nyelven). 69 (1A): S1–S111. 2019. január 1. doi:10.1099/ijsem.0.000778. ISSN 1466-5026. OSTI 1254416. PMID 26596770.
- ↑ Oren, Aharon; Garrity, George M.; Parker, Charles T.; Chuvochina, Maria; Trujillo, Martha E. (2020). "Lists of names of prokaryotic Candidatus taxa". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 70 (7): 3956–4042. doi:10.1099/ijsem.0.003789. ISSN 1466-5026. PMID 32603289.
- ↑ Whitman, William B.; Sutcliffe, Iain C.; Rossello-Mora, Ramon (2019. július 1.). "Proposal for changes in the International Code of Nomenclature of Prokaryotes: granting priority to Candidatus names". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (angol nyelven). 69 (7): 2174–2175. doi:10.1099/ijsem.0.003419. hdl:10261/203982. ISSN 1466-5026. PMID 31066658.